Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Rpusd2Q149F1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Rpusd2Q149F1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Rpusd2Q149F1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Rpusd2Q149F1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Rpusd2Q149F1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Rpusd2Q149F1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Rpusd2Q149F1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rpusd2Q149F1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpusd2Q149F1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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