Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cntnap5bQ0V8T8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms