Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rab42Q0PD08 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab42Q0PD08 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms