Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttc21bQ0HA38 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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