Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms