Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cntn3Q07409 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms