Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gdf3Q07104 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms