Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox4Q06831 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms