Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrx2Q06348 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrx2Q06348 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms