Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CkbQ04447 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms