Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn6Q03958 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms