Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl7Q03366 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms