Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddr1Q03146 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms