Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nhlh1Q02576 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlh1Q02576 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms