Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snai1Q02085 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snai1Q02085 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms