Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RykQ01887 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RykQ01887 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RykQ01887 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RykQ01887 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RykQ01887 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RykQ01887 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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RykQ01887 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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RykQ01887 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RykQ01887 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RykQ01887 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms