Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1cQ01815 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1cQ01815 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms