Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelpQ01102 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms