Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SmsP97355 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SmsP97355 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SmsP97355 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SmsP97355 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmsP97355 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SmsP97355 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmsP97355 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmsP97355 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmsP97355 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmsP97355 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SmsP97355 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmsP97355 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmsP97355 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SmsP97355 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmsP97355 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SmsP97355 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmsP97355 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmsP97355 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmsP97355 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmsP97355 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmsP97355 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmsP97355 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmsP97355 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmsP97355 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmsP97355 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmsP97355 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmsP97355 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmsP97355 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms