Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms