Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vgll3P85442 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms