Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms