Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cbx1P83917 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx1P83917 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms