Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcgP82348 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcgP82348 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms