Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Irx1P81068 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irx1P81068 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms