Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx3P81067 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx3P81067 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms