Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms