Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ptprn2P80560 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptprn2P80560 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms