Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad1P70340 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms