Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgif1P70284 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms