Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp46P62069 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp46P62069 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp46P62069 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms