Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ActbP60710 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ActbP60710 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ActbP60710 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ActbP60710 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ActbP60710 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ActbP60710 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ActbP60710 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ActbP60710 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms