Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpa1P57784 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpa1P57784 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms