Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gp1bbP56400 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gp1bbP56400 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms