Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms