Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp1P55194 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms