Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PltpP55065 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PltpP55065 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PltpP55065 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PltpP55065 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms