Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PctpP53808 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PctpP53808 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PctpP53808 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PctpP53808 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PctpP53808 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PctpP53808 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PctpP53808 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PctpP53808 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PctpP53808 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PctpP53808 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PctpP53808 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PctpP53808 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PctpP53808 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PctpP53808 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PctpP53808 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PctpP53808 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PctpP53808 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PctpP53808 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms