Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb41l4aP52963 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb41l4aP52963 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms