Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lbx1P52955 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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