Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcnfP51944 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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