Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MipP51180 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MipP51180 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MipP51180 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MipP51180 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MipP51180 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MipP51180 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MipP51180 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MipP51180 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MipP51180 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MipP51180 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MipP51180 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MipP51180 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MipP51180 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MipP51180 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MipP51180 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MipP51180 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MipP51180 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MipP51180 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MipP51180 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MipP51180 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MipP51180 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MipP51180 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MipP51180 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MipP51180 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MipP51180 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MipP51180 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MipP51180 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MipP51180 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MipP51180 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MipP51180 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MipP51180 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MipP51180 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MipP51180 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MipP51180 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MipP51180 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MipP51180 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MipP51180 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MipP51180 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MipP51180 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MipP51180 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MipP51180 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MipP51180 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MipP51180 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MipP51180 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MipP51180 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms