Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa6P50704 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms