Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TubP50586 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TubP50586 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TubP50586 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TubP50586 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TubP50586 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TubP50586 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TubP50586 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TubP50586 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TubP50586 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TubP50586 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TubP50586 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TubP50586 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TubP50586 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TubP50586 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TubP50586 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TubP50586 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TubP50586 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TubP50586 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TubP50586 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms