Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpbP50405 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpbP50405 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpbP50405 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpbP50405 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpbP50405 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms