Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbrP50284 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LtbrP50284 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LtbrP50284 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms