Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psen1P49769 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psen1P49769 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms