Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rab11bP46638 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rab11bP46638 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rab11bP46638 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab11bP46638 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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