Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik2P39087 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Grik2P39087 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms