Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PpargP37238 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PpargP37238 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PpargP37238 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PpargP37238 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PpargP37238 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PpargP37238 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PpargP37238 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PpargP37238 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpargP37238 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpargP37238 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpargP37238 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpargP37238 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpargP37238 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpargP37238 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpargP37238 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpargP37238 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PpargP37238 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpargP37238 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpargP37238 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpargP37238 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpargP37238 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpargP37238 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms